關于年休假補償，病假工資，離職法定補償金的問題

我在一家廣州的公司工作，現在合同到期單位提出不續簽。在3年合同期內我沒有休過年假，現向公司討要3倍經濟補償，公司不給。在合同到期前我請了病假，有醫院病假證明。現在公司不賠償年休假，說“自己沒有申請休就沒了”，也沒有支付病假工資。
公司是廣州注冊公司，勞動合同約定工作地點在上海，上海有個小辦公室但上海并沒有注冊。我實際是在南京在家辦公，社保也交在南京。請問我該在上海申請仲裁，還是在南京仲裁。如果仲裁我要求3年年休假和病假工資，我能贏嗎？
感覺公司好像很有把握仲裁能贏，最后甩給我的是“反正我們不賠，你想怎么樣就怎么樣），我該怎么辦呢？
問過南京的仲裁，回答“年休假不受理，江蘇有規定，要勞動監察處理”，但勞動監察說“外地企業，我們沒辦法”。
后咨詢朋友，說應該到上海仲裁，因為我的勞動合同約定的工作地點是上海。但實際上，我除了出差，都是在南京的。另，到目前我還沒有辦理離職手續，公司崔辦，說一周內不辦，就“視作放棄了法定補償金”，3個月工資，就這么沒了？目前我還在請病假（病已經好了），如仲裁我贏不了，我也不用給醫生講好話，開證明了。