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地球上的所有生物不是雜亂無章的堆積，各種生物之間有著直接或間接的關系，彼此互相影響，相互制約，形成有規律的組合。物種之間的復雜關系，不僅影響著物種的生存，同樣影響著物種的進化。一群體的進化與其他群體的進化相互影響，這種變化發展過程叫共進化。共進化現象在自然界中普遍存在。就捕食現象而言，在長期的自然選擇過程中，對被捕食者來說，最善于逃過捕食者的動物，最能生存下來并繁殖后代。自然選擇向著避免被發現、被捕食的方向發展。對于捕食者來說，自然選擇則朝著最靈活、最強壯和最善于捕食的方向發展。這種復雜的適應性是長期進化的結果。
草原狼是鹿的天敵。在這對捕食和被捕食的關系中，強壯、狡猾、奔跑快速和活動靈活的狼能有有效地捕到鹿，生存和產生后代的機會就大；病殘、奔跑速度慢和呆板的狼，由于捕不到足夠的食物而被淘汰。身強力壯、奔跑快速和活動靈活的鹿能避免狼的追捕，最能生存下來并繁殖后代；體質弱、奔跑速度慢和反應遲鈍的鹿則成了狼的美餐，而被淘汰。通過狼與鹿的長期相互選擇而共同進化，使生存下來的狼和鹿都是對環境高度適應的強壯群體。
19世紀末，挪威為了保護雷鳥，曾大力人工捕殺雷鳥的天敵。其結果不但沒有能有效地保護雷鳥，相反，該鳥在20世紀初則大量死去。經調查研究發現，原來雷鳥天敵所捕食的雷鳥大多是體弱多病的個體。患病雷鳥的淘汰，不僅防止了疾病在雷鳥中的傳播，還減少了對生境的競爭，使雷鳥種群得以健康發展。天敵被獵取后，患病雷鳥的活動，使疾病在雷鳥中廣為蔓延，并導致大量死亡，種群不能正常發展。上述事實說明，在長期的自然選擇過程中，捕食者和被捕食者之間發展成為相互依賴的關系，從而促進雙方的進化，即共進化。
寄主與寄生物之間同樣存在共進化現象。1859年引入澳大利亞的24對歐洲兔，由于新環境中缺少天敵和直接競爭者，以很快的速度進行繁殖并形成了數量很大的群體，變成了農業的一大公害。為了制止兔子的進一步蔓延，195年，人工釋放了一種能使兔子患粘液瘤病的病毒，收效顯著。在第一年，就殺死了澳大利亞兔子的98％，第二年死亡率下降到90％，第三年則降到50％，可見兔子對這種病毒產生了很強的抗性。實驗證明，不僅是兔子的抗性增強了，病毒的毒性也減弱了。為什么會出現這種現象呢？因為，不具抵抗力的兔子感染病毒后就很快死去，不可能產生后代，只有那些抵抗力強的兔子才能生存下來，并產生了后代。故生存下來的兔子都具有很強的抗性。對于病毒來說，毒性亦有差異，毒性強的病毒使兔子感染后很快死去，這種病毒不能在兔子之間傳播而被淘汰；當兔感染了毒性弱的病毒時，在兔子死去之前能生存很長時間，并產生了后代，這給了蚊子更多傳播這種病毒的機會，毒性小的病毒被保留下來。故在自然選擇過程中，毒性小的病毒和抵抗力大的兔子被保留下來了，朝相互適應方向發展，使兔子和病毒得以共進化。
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