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真核細胞rna提取的實驗報告
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一.原理
本方法利用鹽酸胍抑制RNA酶,勻漿裂解細胞,采用有機溶劑抽提去除蛋白質。通過選擇性沉淀RNA分子去除DNA。
二.方法
1.樣品處理
、沤M織樣品處理:取新鮮的組織樣品稱重后,剪碎成約1cm2的組織塊直接加入勻漿液中進行RNA提取,或液氮中速凍-70℃保存。
、瀑N壁培養細胞處理:用PBS洗細胞一次,吸干溶液后將培養板快速移至液氮中冷凍后轉到-70℃保存;或加入1ml勻漿至培養板中直接裂解細胞,然后將粘稠的裂解液進一步勻漿。
、菓腋∨囵B細胞處理:離心收集細胞,用PHS懸浮漂洗再田心收集,若不立即提取RNA,則可經液氮速凍后轉至一70℃貯存備用。
2.加l倍體積鹽酸胍勻漿液[至準備好的樣品細胞中,高速勻漿1min。
3.勻漿液5000g,室溫離心10min。
4.將上清移至一個干凈離心管中,加入0.1體積的3mol/L乙酸鈉(PH5.2),混勻,再加5體積預冷的乙醇,立即充分混勻,-20℃放置至少2小時。
5.5000g0℃離心10分鐘沉淀核酸,棄上清液,室溫干燥。
6,每個提取RNA的組織或細胞樣品中,加入l0~15min鹽酸胍勻漿液Ⅱ,攪拌溶解。
7.加入2.5體積預冷的乙醇,立即充分混勻,-20℃至少放置2小時。
8.5000g0℃離心10分鐘沉淀核酸,去上清,室溫揮發乙醇。
9.按每克組織細胞加5min的比例.分兩次加入0.02mol/LEDTA(pH8.0)先加1/2體積EDTA振蕩l~2分鐘,3000g離心2min.吸出上清.再加另一個1/2體積的EDTA振蕩l一2分鐘.合并兩次核酸溶解液。.
10.用等體積氯仿—正丁醇(4:1)抽提核酸溶液,5000g室溫離心l0min,5000g室溫離心10min。吸出上清至另一個干凈離心管中。
11.加3倍體積lmol/L乙酸鈉(PH7.0)混勻,-20℃放置1h以上,此時RNA將選擇地沉淀,而DNA仍為溶解狀況。
12.5000g,0℃離心20min,沉于管底的是RNA。
13.吸去上清,用4℃預冷的lmol/L乙酸鈉(pH7.0)漂洗RNA沉淀。然后20℃5000g,離心20分鐘;厥誖NA。
14.盡量去除上清液。按每g組織細胞1m的比例加入RNA溶解液(0.2%SDS,0.5%mol/LEDTA,pH8.0)。注意:若有SDS沉淀析出.滴加0.11mol/LNaOH調溶液pH至7.5。
15.加入2倍體積冰預冷乙醇混勻,0℃放置至少2小時,5000g,4℃離心10分鐘,RNA沉淀用70%乙醇漂洗,短暫離心后,棄上清,室溫干燥蒸發乙醇。
16.用適當小容積DEPC處理過的ddH2O溶解RNA沉淀,加入3倍體積乙醇,
-70℃保存RNA備用。用時.加入0.1體積的3mol/L乙酸鈉,混勻,120xxg,4℃離心回收RNA。
三.試劑
1.鹽酸胍勻漿液Ⅰ
成分:8mol/L鹽酸胍(分子量為95.6),O.1mol/L乙酸鈉(pH5.2),5mmol/L2—巰基乙醇,0.5%十二烷基肌氨酸鈉
配制方法:取191g鹽酸胍.加8.35m13mol/L乙酸鈉(pH5.2)和6.25ml0.2mol/L2—琉基乙醇溶液中,再加水至237.5ml,混勻后加12.5ml10%十二烷基肌氨酸鈉,振蕩混勻溶解。
2.鹽酸胍勻漿液Ⅱ
成分:8mol/L鹽酸胍(分子量力95.6),0.1mol/L乙酸鈉(pH5.2),1mmol/L2
—琉基乙醇,20mmol/LEDTA(pH8.0)
配制方法:取191g鹽酸胍,加日.35ml3mol/I。乙酸鈉(pH5.2)和1.25ml0.2mol
。疞2—巰基乙醇溶液中,再加入10ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)。加水至250ml混勻。
3.乙醇
4.70%乙醇
5.氯仿—正丁醇(4:l,體積比)
6.4mol/L乙醇鈉,pH7.0
7.3mol/L乙醇鈉,pH5.2
8.RNA溶解液
成分:O.2%SDS.0.05mol/LEDTA,pH8.0
四、說明
提取RNA時,要特別注意防止RNase的污染,所用玻璃器皿均應用0.1%的二乙基焦碳酸鹽(diethylpyrocarbonate,DEPC)處理。塑料器材均使用一次性用品,并高壓滅菌處理,必要時,也可用0.1%DEPC處理。
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